到了17世纪，培根在自然科学方面，笛卡尔在狭义的哲学方面，放弃了一直被人们公认的公式，打破了传统在学术界的统治，推翻了巨擘们的权威。这一时期的哲学追求“体系精神”，采取证明和演绎方法，即从一般的原理、概念和公理出发，推导出关于具体的知识。笛卡尔之后的形而上学大家们，斯宾诺莎、莱布尼茨等通过反思他的哲学也建立起自己的思想体系。