血流方向是指被检测血管内血液流动方向相对于探头发射声波的方向。血流是有方向的，TCD可以检测到血管内流动血流的方向，在TCD检测中通常将朝向探头方向的血流标记为正向血流，多普勒频谱位于基线以上称为正向频移；而将背离探头方向的血流标记为负向血流，多普勒频谱位于基线以下称为负向频移。在血管分叉部位检测出来的血流可以是双向的，代表着不同血管走行、不同血流方向的血流。