长庆二年（822）正月，幽州前线已经聚集了各道军队十七八万人，宰相裴度亲临督战。然而，在朝内奸臣的阻挠下，各军难能协调，屡屡受挫，士气更是低迷。正月初五，防守严密的弓高陷落。中书舍人白居易上书指明问题所在，请求让裴度兼招讨使，率领太原全军，协调各部四面进逼。穆宗无心政务，哪里听得进去。不过，他还是不断地嘉奖和表彰，以激励将士报效国家；同时，将裴度进位检校司空，兼充押北山诸蕃使。
裴度作为三朝元老，文韬武略驰名中外，各少数民族都很仰慕他。进剿王廷凑的战事吃紧时，回鹘主动请求带兵从征。裴度获悉后，担心未能助战，反倒添乱，形成所谓“请神容易送神难”的局面。于是，他立即派使前往阻止。然而，使者还是晚了一步。回鹘的武将李义节发兵三千已到达丰州，没捞到好处，拒绝回师。朝廷无奈赏回鹘军缯帛七万匹，回鹘兵马才回归本部。
穆宗昏庸，专宠元稹。而时任翰林学士的元稹，与知枢密魏弘简是刎颈之交。他们勾结皇帝的近侍官员，意欲谋求充任宰相。元稹虽与裴度无仇无怨，但非常忌妒裴度的声名在自己之上。裴度在山东指挥作战时，每每处置军务都有所论奏，但多被元稹留持。无奈之下，裴度三次上疏穆宗，奏论此事。穆宗虽不高兴，但惧怕大臣们议论，于是调任魏弘简为弓箭库使，同时免去了元稹的学士之职。穆宗虽然贬斥了元稹，但偏宠元稹的心意却丝毫未减。长庆元年（821）二月，穆宗看时机成熟，就又起用元稹为宰相。元稹想罢掉裴度的兵权，就劝穆宗洗雪王廷凑罪名，并就此罢兵。二十五日，裴度奉命以平章事兼任司空衔，去任东都留守。谏官们知道这是元稹怂恿皇帝闲置裴度，纷纷上奏。穆宗为了躲开谏官，一连几日不上朝，也不召见臣僚。朝官们又联名上书，说：“眼下兵事正酣，裴度有将相全才，不应当投闲置散。”穆宗只好顺应人心，派人转告裴度先回朝，再赴任东都，并暗中准备另作安排。
三月十七日，裴度回到长安朝见穆宗，一再向皇帝谢罪，诉说讨贼无功是自己的无能。说到国事艰难，动情之下，他仆伏龙墀，涕泪横流，呜咽得几乎说不出话来。穆宗深受感动，但元稹等人的耳边风仍然劲吹不止，裴度也因此没有得到应有的重用。二十一日，穆宗诏令裴度守司徒一职，兼扬州大都督府长史，充淮南节度使。“司徒”为一品，品阶高于宰相；扬州是重要的商业城市，又为水运要枢。如此重任，不可小视。但是，对于裴度来说，情况就另当别论。下诏后，议政者无不说裴度是国家中流砥柱，不能远遣朝外。二十七日，皇帝只好再下诏，恢复裴度宰相职务，留在朝内辅佐政事。六月十八日，在众臣请求下，穆宗又加封裴度为平章事。
长庆三年（823），李逢吉内结宦官，外煽朝臣，千方百计排挤裴度。他们到处说裴度的坏话。当时支持裴度的朝臣也不乏其人，但这更使得裴度成为争论的焦点。穆宗认为朝中是非均起于裴度，于是便于八月强令裴度出京，去任山南西道节度使（时称兴元府，治今陕西汉中市）。十一月，穆宗中风，不能下地，群臣许久难见皇帝一面。裴度感到情况严重，就三次上疏，请求早立太子，并要求尽快面见天子。十二月，穆宗终于在紫宸殿接见了群臣，下诏立景王为太子。皇储即定，社稷随时有人继承，裴度才放下心来。
长庆四年（824）正月，穆宗一命归西，敬宗即位。此时，李逢吉向敬宗谎称裴度等大臣反对其即位等等，年方十六的敬宗，还没有弄清做皇帝的职责，便被李逢吉的谗言弄迷糊了。他也感到有裴度这样的元老让自己不自在，该撵出朝去。二月，唐敬宗偶然翻检禁中文书时，看到裴度、杜元颖、李绅当年请求立太子的奏疏，才明白李逢吉、元稹等人所说皆为谎言，不由感慨万端。
当年六月，襄阳（今湖北襄阳市）节度使牛元翼一家被王廷凑血洗。十七日，听到消息的敬宗在朝堂上感慨所任宰相非人，祸国殃民。翰林学士韦处厚向皇帝上疏，举荐裴度。牛元翼惨案后，朝中舆论对李逢吉不利，其党羽便千方百计阻拦敬宗再度起用裴度。一来二去，敬宗也明白了事情的原委。此后，敬宗每逢宦官路经兴元，都要传密旨慰抚裴度，还约好了征裴度回朝的日期。
宝历二年（826）正月二十四日，裴度回朝，敬宗隆重接待。二月初九，裴度又被任命为司空、同平章事，重掌朝政。入春，敬宗决意巡幸东都，并命度支员外郎卢贞前往勘察、修缮宫殿及沿途行宫。裴度至延英殿劝谏道：“国家建起两座都城，就是为皇帝巡幸准备的。然而，皇上移驾，一举而牵动全局，影响远近。何况自战乱以来，这种事就断绝了。这些年，东都的宫殿以及百司廨署，早就荒圮。陛下执意要巡幸的话，也得让他们稍事修葺。等过个一年半载的，宫殿都像个样子了，方能议定起行之日。”敬宗说：“群臣劝了好久，都没有言及此意，只是说不该去。倘若像你这么说，朕不去也罢，又何必日后呢？”消息传出不久，朱克融、史宪诚都上奏，请求派五千工匠帮助修缮东都，实则在向朝廷示威施压。三月，敬宗见大驾未动，已招来麻烦，才认识到问题并不如他所想的那么简单，只好放弃了巡幸计划。
敬宗贪图享乐，游戏无度，常与一班宦竖宵小厮混。更糟糕的是，他对宦官滥施刑罚，常干一怒杀人的事。这引起一些手握兵权的宦官的不满。这年二月的一天晚上，苏佐明等暗杀了敬宗。原来，敬宗爱与宦官们出宫打狐狸。这天因没打到猎物，十分恼火，打这个骂那个。当时敬宗如厕，在场的二十几个宦官预感性命难保，就趁机弄灭了蜡烛，勒死了敬宗。次日，这些人宣读了刘克明等人矫郭太后（郭子仪孙女）的旨意，拟定诏制，由绛王李悟在紫宸外庑召见宰相百官，宣达噩耗，声称敬宗暴病而亡。枢密使宦官王守澄、杨承和，中尉魏从简、梁守谦等分析形势，感到刘克明等人有篡权的可能，便一起派兵迎江王李涵（穆宗子）入宫即位，是为文宗；同时，他们发动左右神策军、飞龙兵尽诛刘克明等弑逆贼党。
文宗即位，裴度因功加授门下侍郎、集贤殿大学士、太清使诸官职，其他职位依旧；以辅佐导引的功勋，又晋升官阶为特进。那时，沧景节度使李全略刚去世，其子李同捷窃取兵权，谋求承袭父职。裴度奏请讨伐。历经数年，李同捷被诛。
裴度年岁高迈而又多病，上疏恳请辞去军政机要职务，皇帝对他的礼遇更加隆厚。文宗派宫廷医师替他诊断治病，每天让宫廷使臣前去安抚慰问。太和四年（830）六月，文宗下诏赐裴度以三公辅臣的尊崇册封礼仪。裴度上表辞让，文宗以优容态度下诏依从了他的请求。九月，裴度以加守司徒、兼侍中、襄州刺史的身份，担任山南东道节度使、观察使、临汉监牧使。
裴度一向坚贞正直，侍奉君主百折不回，因而屡屡遭受奸邪之辈的排挤打击，几乎陷于难以摆脱的艰难窘迫的困境。到了晚年，渐渐追随世俗以避免身遭祸事。起先，度支盐铁使王播，大肆向朝廷进献财物，得到了皇帝的宠信。裴度后又引荐韦厚叔、南卓担任补阙拾遗，以求弥合矛盾，扩大交结。即便如此，宰相李宗闵、牛僧孺等仍视之为绊脚石，趁裴度因病辞官之机，罢免了他的宰相职位，然后又将他调出京都担任襄阳节度使。
文宗认为，裴度虽然脚有毛病，来京朝见君主不太方便，但他精力尚未甚衰。开成二年（837）五月，文宗又让他以本官职兼任太原尹、北都留守、河东节度使。诏书发出后，裴度连续上表，以年迈有病推辞，不愿再掌兵权。文宗复诏不允。文宗派吏部郎中卢弘去往东都宣布皇帝诏书，催其起程，裴度不得已而赴任。
开成三年（838）冬季，因不堪北国风寒，裴度病情加重，祈请返回东都养病。开成四年（839）正月，文宗下诏准许裴度返回京城，授官中书令。裴度因病不能入朝向皇帝谢恩，文宗下诏书说：“司徒、中书令裴度，多有大功，历居三台之位。现因疾病，未能入朝谢恩，并请假在家疗养。按朝廷制度，请假期间须减俸，甚至停发俸禄，但他所任本官的俸禄食粮，应依旧计日支给。”又派御医去给他治病。适逢三月初三上巳节，皇帝在曲江池赏赐宴饮，群臣赋诗，裴度因病不能赴宴。文宗派宦官赐给裴度诗一首：“注想待元老，识君恨不早。我家柱石衰，忧来学丘祷。”随诗，文宗还附亲笔信札说：“朕诗集中想见到你的唱和诗，因此将此诗寄给你看。你病未痊愈，必定乏力和诗，改日尽快将和诗呈上。春季养病，需要尽力调养，尽快血气和顺。心中怀念千百，所写不及一二。医药治病，不要顾忌频繁奏请。”
文宗的亲笔书信到裴度家门口时，裴度已经逝世，时间是开成四年（839）三月初四。文宗听到噩耗后，惊悸悲痛了很长时间，又让人重新缮写了那封亲笔信，将它放在裴度的灵位前，同时文宗下诏追赠他为太傅，加等赐给他家助葬的车马、布帛、财物；下诏由京兆尹郑复监护料理丧事，办理丧事所需的东西，全由官府供给。文宗诧异裴度没有遗表，宦官去他家询问这件事。家属搜寻半日，才呈上只写了一半的遗表草稿，其仍以皇帝尚未确定皇储为忧虑，没有一句谈及家事。自当日起，文宗特停朝四日，以示哀悼。裴度一去，震动邦国内外，河南河北、东京西京，男女老幼，知与不知，莫不尽哀。
裴度虽是文臣，却能挺身赴难，率兵讨逆，一度重整山河，中兴大唐。穆宗时期，藩镇死灰复燃，却慑于裴度威名，而不能撼动全局。裴度虽然相貌平平，却内涵隽秀，器识宏大，为人豁达，尤其其机智应对，口才雄辩，见识者无不动容。他以一颗丹心，一腔正气，遍治诸州，历仕六朝，宰辅四帝，五度入相。裴度虽五次被排挤，仍百折不挠。从元和年间闻名朝野之后，裴度就一直担负着元臣宿望的重要角色，连边民外邦都久慕其风采，多有欲充其马前卒者。他出将入相，身系天下安危二十余年，人们都视其为当世郭子仪。历史评价他的风范可比东晋时期的王导、谢安；而安邦定国的才能谋略，较之王导、谢安更胜一筹。
更难得的是，他贫寒中能香山还带，富贵中肯义还原配；在上尽忠，在下安民；遇乱能镇定，处事能谋远；邦国缺少了他，“柱石衰落”；地方没有他，一方不宁。他是著名的中唐贤相，华夏社稷之良臣，更是后人学习效法的楷模，将他列入乡贤祠永远奉祀。他的“绿野堂”传承了裴氏家风，他的功绩光映日月，其刚正铸就了裴门的士人傲骨。因此，裴氏后人对他倍加推崇，为他特建裴晋公祠，以志纪念。每年农历三月初三，他的家乡裴柏村一带还会举行万人齐集的裴晋公庙会，瞻仰晋公遗像，缅怀其风烈。