吞世者
原体对第十二军团之主有一种敬意。他认为对方即使在被植入屠夫之钉、身为角斗奴隶的情况下依旧选择带领奴隶们反抗万恶的奴隶主统治，真正体现了人类的不屈精神。而最终安格隆被帝皇强行拉走，留下起义队伍被奴隶主屠杀并最终接受了奴隶主们继续统治这颗星球也让原体无法理解。在原体看来，这是人类帝国进行大远征的意义就在于将人类从异族和暴政手中解救出来，如果还继续放任他们统治当地的人类，那又何必进行大远征呢！出于尊敬，原体一直希望能和安格隆面对面的交谈，但双方总是相隔甚远。
军团和吞世者唯一一次共同作战的记录是军团远征一个以星际劫掠为生、被称为“阿尼查”的异形种族，当时军团在该星区偶遇一支在亚空间迷航的吞世者舰队。当军团舰队刚刚发射完鱼雷，准备将敌人舰队纳入宏炮和光矛射程时，吞世者这支小舰队已经一马当先冲进了敌舰阵型并发射了跳帮鱼雷。
这一鲁莽的行为让军团吓出了一身冷汗，并被迫取消了后续的远距离打击行动。当军团援兵同样跳帮到敌军舰船时，他们发现了满地的敌人尸体和陷入亢奋的吞世者们，并眼睁睁看着他们所过之处一片狼藉。
极限战士
第十三军团应该是和军团最能谈得来的军团。罗伯特.基里曼和原体互相认同对方的建军理念并共同认为大远征的目的不仅是征服和毁灭，而是要为人类带来一个繁荣、和平的银河。两位原体也曾彻夜长谈关于大远征结束后的愿景。基里曼认为在大远征结束、银河迎来和平之后，阿斯塔特们应当由战士变为学者和领袖，继续带领人类前进，而原体则认为基里曼的理想应当更进一步：“帝国的各种工作没有高低之分，如果阿斯塔特可以作为领袖和学者，那为什么不能作为工人和农民存在于帝国之中？”
原体由此更深入的提出了一个让基里曼毛骨悚然的推测：“如果我们和我们的军团不能在战争结束后融入帝国的和平时代，那结局要么是离开，要么是被清洗！”
由于这个推论过于骇人，基里曼听完后便起身告辞，但这不影响两位原体在之后频繁的书信往来和两个军团的协同作战。
死亡守卫
两个军团并没有配合作战的记录，同时原体和十四军团之主莫塔里安也没有什么交集，但原体对十四军团的坚韧不屈非常欣赏，号召过军团向十四军团学习。
千子
在银河东部的一次征服里，第二军团第一次遭遇了信奉混沌邪神、可以召唤亚空间生物的异形种族。当这些奇奇怪怪的“异形”从亚空间裂缝一跃而出，五花八门的巫术、无视枪炮的能力和迅捷无比的身影都让第二军团感觉非常难受。虽然第二军团的灵能抗性让他们某种程度上可以消弭亚空间能量带来的影响，但同时也让他们的反击手段变得稀少，只能依靠残酷的近身肉搏与敌人厮杀。随着亚空间裂缝的扩大，更多亚空间生物涌入实体宇宙让军团被迫缓慢后撤。
关键时刻，千子的援军在原体马格努斯的带领下赶到战场。千子们熟练的运用灵能技巧不仅直接摧毁了很多恶魔，还让第二军团的杀敌速度大大提高，并随同军团一起发起反攻。
随后在马格努斯的亲自主持下，一个大型仪式被成功施放，亚空间裂隙被瞬间关闭，失去后援的恶魔们在两个军团的协作围剿下很快被消灭殆尽。
战斗结束后，原体对十五军团的灵能力量印象深刻，邀请自己的兄弟和他的子嗣共同研究是否有办法突破第二军团的灵能抗性让自己的军团也能使用灵能——这一努力最终以失败而告终。但在千子的帮助下，对之前俘虏的暗黑灵族的灵能装备研究取得了进展，这也让第二军团终于能在某种程度上获得灵能的好处。当然，这项研究的成果还非常原始，必须在漫长的岁月中持续不断的改进。
影月苍狼
十六军团与荷鲁斯某种程度上曾经是军团的“老大哥”。军团从十六军团身上学到了很多“战士之道”和战略战术思想，这让军团的战术进一步丰富。荷鲁斯本人的能力和人格魅力也让原体折服，特别是荷鲁斯孜孜不倦调解原体和其它兄弟之间关系的举动让原体本人很是感动。但是在这一派祥和里，原体曾私下表示过对荷鲁斯和影月苍狼军团的过分骄傲表示担忧，认为这很可能在多年以后造成对帝国的伤害。
怀言者
如果说第二军团最厌恶的是谁，那一定非怀言者的神棍莫属。
受原体影响，第二军团敌视一切宗教，对怀言者每到一地就传播宗教、建立教堂的行为更是不屑一顾。甚至曾经发生过怀言者前脚刚离开一个星球后脚第二军团就在星球上驱散所有宗教人员、焚烧宗教典籍、宣讲帝国真理并将神庙和教堂改为科研和政治场所的事件。
于是在荷鲁斯面前，一场激烈的争吵在原体和罗嘉.奥瑞利安之间展开。
罗嘉言辞激烈的指责第二军团的手“伸得太长”了，并借题发挥将第二军团不跪拜帝皇雕像、长期将“帝国”置于“帝皇”之前的不敬以及原体从来就不对自己的父亲顶礼膜拜等事情全部摆出来当作“罪证”，要求原体和他的军团跪在帝皇面前忏悔。
原体同样情绪激动，他愤怒的斥责怀言者那套神棍的把戏不但不是对帝皇的尊重，反而是在把有血有肉的帝皇庸俗化：“你以为你们树立他的神像、建立他的庙宇就是对他的尊敬？你们崇拜的到底是我们的父亲还是一个仅仅存在于你们想象中用来为自己那空虚的精神的伪神？不，我的兄弟，你在对他顶礼膜拜的时候，甚至不曾想过去深入了解他！他是个有血有肉，有智慧有感情的人，和你我、和军团、和帝国所有人民一样的人！他教导我们，他指引我们，但他绝对不希望我们去跪拜他！尊敬他的最好方式是即使他不在了，我们也可以沿着他的理想为了人类的明天继续前进！”
原体甚至声称：“在我看来，你们的那些仪式、那些祷言根本就是你们为了满足自己而非尊崇我们的父亲搞出来的，如果我们的父亲不在那个位置，你们就会去寻找另一个！”
这场言辞激烈的交锋最后随着荷鲁斯的强力干预而终结，第二军团和第十七军团自此分道扬镳。
对于荷鲁斯裁定的第二军团应当修复怀言者的神庙并且不再干涉这颗星球上的任何事务的裁决，军团照办了。但当怀言者们兴致勃勃的来到被第二军团重建的神庙前时，发现神庙主体结构是修好了，但其上被第二军团改造成了一个充满机械和电子设备，二十四小时播放帝皇要求人们反对迷信，信仰科学和理性的公开演讲的全息影像广播塔。
怀言者们站在塔前久久无语，最终选择离开了这颗星球。
火蜥蜴
火蜥蜴和第二军团志趣相投，伏尔甘和原体也算是惺惺相惜，认为自己和自己的军团相互之间都非常类似：二者都认为阿斯塔特接受改造手术，获得超人力量既是一种荣耀，也是一种责任。这些“超人力量”不是为了压迫凡人或者在他们面前自高自大，而是为了保护、服务帝国人民而存在的。在进行作战行动时，两个军团也同样会尽力减少平民的伤亡。
而第二军团对火蜥蜴崇尚技术和铸造也非常钦佩。但与火蜥蜴对产品精致追求到极致不同，第二军团始终认为产品最重要的是稳定、适合量产并且愿意为此付出一定性能上的代价。二者最大的合作项目是曾一起试图让古老的爆炎武器重新变成帝国的可量产装备并取得了突破性的成果，但对最终技术路线的分歧还是对最后的结果产生了影响：为了消除双方在技术路线上的分歧，火蜥蜴派出一支技术小队带着伏尔甘本人的设计图和意见前往第二军团的旗舰，试图再一次以商谈的形式消弭双方分歧（主要技术资料由第二军团保管），据信他们抵达了目的地，但不知道什么原因没有返航——随后这支小队也跟第二军团一起，消失在了帝国所有的记录里。
暗鸦守卫
第二军团的战术风格多变是大远征时期所有帝国军队的共识，这既是他们在原体回归之前曾跟随不同军团作战的烙印，也是原体回归后刻意延续的结果。
原体认为：黑暗的银河中散布着许多不同的种族，有各自的文化、思维、科技和战争理论。帝国军队在征战银河时会面对不同的敌人，如果作战方式一成不变很容易被人克制。在这种前提下，军队需要像海绵一样不断吸收其它帝国军队甚至异形的作战思想，为此，第二军团向其它所有军团派出了观察组以考察其它军团的作战方式。
克拉克斯和第十九军团对来自第二军团的战士们非常欢迎。一方面，这些战士“非常聪明”，对于十九军团的作战方式并没有花太多的时间就轻松适应，一些佼佼者甚至获得了进入十九军团原体卫队实习的荣誉。另一方面，第二军团善于调查、能从信息中抽丝剥茧获得情报的能力也让暗鸦守卫非常喜爱，这能有效为他们更快找到打击的关键节点。
克拉克斯曾经写信给原体，建议双方相互派出部队纳入对方建制内长期配合作战。十九军团之主认为这对两个军团都是好事，可以有效加强双方效率。
遗憾的是，这个建议提出后不久，第二军团就从帝国的一切信息里消失了，原体的答复和这个计划的最终结果不得而知
阿尔法
有人认为第二军团和第二十军团很可能是帝皇特意打造的“镜像”军团。如果说第二军团擅长的是从多个维度建立一个秩序，那第二十军团就擅长从各个维度拆毁一个秩序。在大远征中，两个军团在官方记录里缺乏相互配合作战的记录，但据很多第二军团老兵说，他们在征服一些世界的过程中发现当地原本稳固的秩序在他们抵达前数月突然崩溃，而经过仔细调查又能发现一些帝国方面活动的蛛丝马迹，这让两个军团是否真的有过合作变得扑朔迷离了起来。
为一可信的是，两个军团的原体从没有碰过面，一直到第二军团从帝国记录里消失都是如此。