余山海登顶最强者训练家称号已经过去了三年，这三年里余山海致力于打击vir组织犯罪集团，不过效果并不明显，对vir组织的抓捕行动只能说是不痛不痒。
而风原也在合众飞云市郊区的皇家私立学院学习了将近四年的知识，即将从预备学院升入飞云市位于市区的皇家私立学院，成为一名正式的训练家，袁耀夫那只受过伤的时拉比留在风原身边这几年将自身伤势养好许多，不过风原并没有用时拉比对战过，在学校有专门的战斗神奇宝贝来进行战斗，所以风原的同学几乎都不知道有时拉比的存在。（以上剧情可搜索《神奇宝贝之余山海篇》进行观看）
皇家私立学校，顾名思义，是由合众地区的古皇室创办，向各个地区招生，预备学院和正式学院的学费都非常贵，所以能在这里上学的学生大都家里条件不错，而风原以整个预备学院文化成绩第一升入了皇家私立学院的正式学院。
“你就是这一届预备学院里的第一名风原是吧。”风原由自己预备学院的老师热运老师亲自带到了正式学院，而风原其实全名叫做百慕风原，但由于余山海到处打击vir组织犯罪集团，所以余山海和百慕毓婷将百慕风原的名字去掉了姓氏，避免遭到报复。
拿着风原资料的老师抬头看了看眼前的少年，一头蓝色自然卷短发，黑色的瞳孔看起来真诚无害，并没有一个第一名理所当然有的骄傲或者谦虚情绪，一眼看过去，少年的脸上都是平静。
“是的，老师。”风原将自己的成绩表递给面前这位戴着眼镜的中年男人。
“嗯，我叫蔻义。你作为第一名入学，在搭档挑选这方面可以第一个挑选，你可以从这些神奇宝贝里选一只。”蔻义的电脑上出现一页神奇宝贝的画面，而等风原选完后，剩下的将会先由预备学院升上来的学生挑选，然后再给那些外面报名入学的学生选。
“老师，可以把这些神奇宝贝都让我现场看一下吗？”风原没有过多的解释自己为什么要当面看，光从图片上来看，有些神奇宝贝天生种族值就比较强大，只能这样选，但如果能现场看，那考虑的就多了。
蔻义抬头看了一眼热运，心想是不是这家伙给自己学生出的主意，还要麻烦自己把这么多神奇宝贝放出来。
“那跟我来吧。”蔻义发了条消息，然后起身走出办公室，风原和热运跟上去，而很快就有一个工作人员推着一推车的神奇宝贝球走了过来。
“老师，我自己来放吧，就不麻烦你们了。”风原看了这一车叠了十盘的神奇宝贝球，如果让这工作人员和老师来放，岂不是会让他们觉得自己事太多？
蔻义点点头，心里打量着风原，虽然提了要求，但也不会太麻烦自己，看样子是个省心的学生。
“出来吧。”风原从最上面一盘神奇宝贝球中抽出一颗神奇宝贝球，放出了里面的神奇宝贝，是一只烛光灵，烛光灵看见风原三人，显得有一些胆怯。
风原对烛光灵微微一笑，然后开始打量烛光灵，烛光灵头部的火焰看起来很旺盛，比自己在资料中看到的那些烛光灵火焰要茂盛一些，或许这只烛光灵在火属性方面要比一般烛光灵强一些？而身体发光发亮，说明被照顾的很好，风原毕竟不是专门的培育家，通过表面也只能看到这些。
“烛光灵的成长周期很长。”热运提醒到风原，烛光灵的进化等级很高，进化到第二段需要相当高的等级，而第三段只需要暗之石即可，但作为新生，这种成长周期长的神奇宝贝在学习中会让风原有压力。
“嗯嗯，那就看下一只。”风原收回烛光灵，接着取出下一个神奇宝贝球。
“你们慢慢看，选好了来告诉我就行。”蔻义是一个非常怕麻烦的老师，看风原观察这只神奇宝贝都观察了两分钟，所以打算回办公室等着结果。
“您辛苦了，这边我会替您看好的，您有事可以先忙。”热运对推来神奇宝贝的工作人员说，工作人员点点头，也离开了。
“伊布，可以值得抚养。”热运又看着第二只放出来的伊布说。
“嗯嗯，回来吧。”风原看这只伊布表现出一副慵懒的状态，看样子不是喜欢对战的神奇宝贝，那自己不能选，毕竟自己还有远大的目标要实现，收回伊布接着放出第三只神奇宝贝。
就这样过了将近两个小时，风原将十盘神奇宝贝全部看完了。
“你选好了吗?”热运看风原拿起一颗神奇宝贝球，但并不知道是哪只神奇宝贝，风原也没有去记。
“选好了，热老师，我决定选烛光灵了。”风原点点头。
“它成长周期太长了，你之后的成绩都会跟神奇宝贝挂上关系，可不只是文化课，你成绩一直都很好，老师不希望你在方面受挫，而且不是还有单首龙吗，如果你不在乎成长周期长，那只单首龙也不错。”热运说。
“它是我放出来的第一只神奇宝贝，而且最终形态水晶灯火灵是天赋中等偏上的神奇宝贝，相比单首龙，烛光灵的成长周期短一些，我也不希望未来在没进化之前落后别人太多。”风原认真地说。
“既然你考虑好了，老师一切都支持你，接下来在学校的事情就全靠你自己了，我把你交到蔻义老师手上，他虽然是一个怕麻烦的人，但他也是一个很不错的老师，老师就先回去了，就不留在这边了。”热运说。
“老师再见，我会努力的。”风原点点头，目送热运离开，然后看向自己手中的神奇宝贝球，里面是属于自己的烛光灵。
“出来吧，烛光灵。”风原再次放出了烛光灵，烛光灵这次比刚刚好一些，显得没有那么害怕。
“以后我们就是搭档了，你是我选择的伙伴，以后一起努力吧。”风原蹲下来和烛光灵的说话，烛光灵似乎不太懂风原的话。
风原将烛光灵捧起来，放在自己的肩膀上，然后走回蔻义的办公室。
“老师，我选择好了。”风原敲了敲门，蔻义让风原进来。
“好，你所属班级是一年级一班，宿舍在3号男生宿舍902，这是宿舍钥匙。”蔻义看了看风原肩膀上的烛光灵，然后又给工作人员发了条消息，风原拿着钥匙出办公室时，那工作人员正好把装着很多神奇宝贝球的推车推走。
风原和烛光灵一路往宿舍的方向前去，路上风原也看到了几个之前的同学。
“烛。”烛光灵看着很多学生，显得很胆小，往风原的脖子处靠。
“烛光灵，你很害怕吗？那先回来吧。”风原可不想被烛光灵头上的火焰烧到，用神奇宝贝球将烛光灵收了回来。
风原乘宿舍楼电梯来到9楼，回到了宿舍，宿舍是两人间，上床下桌并且有独立卫浴和一个面积不大的客厅与阳台。
“烛光灵，时拉比，出来吧。”风原放出两只神奇宝贝，自从风原满了15岁之后，时拉比的神奇宝贝球就一直放在风原身上。
“烛光灵，你是我的第二个伙伴，也可以算是我的初学者神奇宝贝，时拉比是陪我相处了很久的伙伴，但因为身体原因，没办法战斗，以后就我们三个要好好相处。”风原轻轻抚摸烛光灵的身体，烛光灵点点头，而时拉比则是坐在风原的肩膀上，能不动用自己的能力就不动用，当初一次复活和连续穿越时空已经让时拉比的本源力量受到伤害。
“烛光灵，休息一下吧，等我收拾好宿舍，我们去尝试一下对战。”风原以前没有指挥过时拉比对战，那是时拉比身体不允许，在预备学院的时候倒也用过学校的神奇宝贝对战，可这跟使用自己的神奇宝贝战斗还是有所区别。
……
“时拉比，我们回到过去吧，为我的行为弥补过错。”一头银色短发的女人，银色短发遮住了女人的额头，而头发刚好垂到耳下，身边是一只异色的时拉比，时拉比颜色与女人的粉色瞳孔相似，女人身穿银色皮衣与银色皮质包臀裙，左脚因为意外受伤而留下疤痕，所以单穿一条银色皮质过膝袜，连脚上的鞋也是银色皮质运动鞋，整个人看起来除尘不染，和周围看起来怪异又破败的世界格格不入。
“拉比。”异色时拉比因为先天不足，穿越时空的能力有很大的问题，当初皇甫念被异色时拉比带到这个几十年后的合众地区就再也没有回去过，已经很多年没有见过自己的父母了，而如今合众地区因为核污染，将近一半的环境遭到破坏。核污染原本就算破坏力再强，也不会这么快让合众地区沦陷，但因为有着科技天赋的皇甫念所研究的核污染转化器出世，导致合众人民在这方面就不太注重环境保护，而核污染转化器其实是不完善的作品，直到合众地区环境出现不可逆的情况，皇甫念才发现自己的发明居然促成合众地区的核污染灾害。
“时拉比，再用一次你的能力，我们一定要回到过去，回到“原色”计划刚开始的时候，为了赎罪。”皇甫念愧疚地看着被染成紫色的河水，心中自责不已。
“拉比。”时拉比点点头，接着双手一挥，用了本源力量，终于凝聚出一个彩色的圆洞，但圆洞的边缘并不平整，弯弯曲曲，也能说明这只异色时拉比的穿越时空能力非常差。
“别了，未来。”皇甫念最后看了一眼周围的环境，接着一脚跨进圆洞，时拉比也跟着皇甫念飞进圆洞。
圆洞内周围的空间变幻无穷，刚开始空间还算稳定，可过了十几秒后，空气开始剧烈抖动。
“拉比！”时拉比大喊，空间开始扭曲，让时拉比和皇甫念紧紧贴在一起。
......
而此时风原的那只时拉比感受到来自多元时空的呼唤，感受到同类的求救信息，不惜动用自己好不容易恢复的力量去引倒对方。
“怎么了，时拉比？”风原看着时拉比身体发出绿光持续了三分钟，随后变得虚弱，问。
“拉比。”时拉比摇摇头，因为语言不通，时拉比没办法向风原解释发生了什么，只好不告诉风原。
“那好好休息，很久没出现身体虚弱的情况了。”风原收回时拉比。