1938年10月12日，日军从惠阳大亚湾实行海上登陆，大举向华南及广州进攻，周恩来即派巡视员黄文杰到广东，主持召开省委紧急会议，传达中央指示。
黄文杰，原名祥庆，乳名观妹，号绚云，1902年生于广东省兴宁县大塘村一户贫苦农民家庭。他聪慧好学，追求上进，连任学生会会长，多次带领同学查禁日货，宣传爱国思想。历任中央执行局职工部部长、中共上海临时中央局代理书记、书记等职。
1935年2月，由于叛徒出卖，黄文杰等30余人被捕。同年9月，黄文杰被判处15年徒刑，转押于南京国民党中央军人监狱。
全国抗战爆发后，国共开始第二次合作，黄文杰被保释出狱。9月底，黄文杰同张文彬到香港，向“南委”传达党中央的指示，很快整顿和加强了南方党的领导力量，张文彬留任“南委”书记。
12月中旬，南京办事处迁至武汉，改名为第十八集团军办事处。党中央派王明、周恩来、董必武、叶剑英、邓颖超、黄文杰等组成中共中央驻武汉代表团，领导南方各省市党组织广泛开展抗日民族统一战线工作。
黄文杰担任长江局组织干部组、工运组、训练教育组的总负责人及长江局秘书长。他根据中央和长江局的决定，首先恢复建立了南京市委，接着为重建破坏殆尽的安徽党组织而日夜奔忙。
安徽党组织的恢复工作刚告一段落，12月27日，黄文杰被任命为长江局驻两广特派员。
黄文杰风尘仆仆地赶到广东，先后同张文彬、廖承志、薛尚实、罗范群等多次召开会议，分析广东形势，较好地解决了南方临时工作委员会与广州市委之间的无原则斗争。
为了适应南方抗战形势，加强广东党组织的领导，他报请党中央和长江局批准撤销了“南委”，并于1938年4月成立以张文彬为书记的中共广东省委。黄文杰又协助省委制定党工作的总方针：坚持独立自主开展群众性的抗日救亡运动；向广东国民党当局较开明的上层人士开展抗日统一战线工作。
经过半年时间，广东省党委的各项工作都取得了显著成绩，党员人数从省委成立时的1300人增至近1万人，地县一级党组织基本上遍及全省各地；统战工作也有新的突破，通过进步人士做工作释放了300多名政治犯。
黄文杰对工作认真负责。1938年7月，他在湖南巡视工作时，接到原中共党员国民党驻琼崖第一五二师政治部上尉科员黄集发的来信，反映了冯白驹被捕后琼崖地区的斗争情况，并要求到解放区去工作。
黄文杰及时回信说：你不需要去解放区，友军里需要人，国统区正需要人，要安心工作；有关琼崖问题，可请叶剑英、廖承志同志解决。他随信附了给叶剑英、廖承志的介绍信。黄集发以此为凭向叶剑英、廖承志汇报了琼崖方面的情况。
1938年9月，中共中央决定设立南方局，由周恩来、博古、叶剑英、黄文杰四人组成。10月12日，日寇在惠阳大亚湾登陆，13日惠州沦陷。
为了应付广州即将沦陷的危局，黄文杰又一次以特派员身份前往广州。他一到广州即与广东省委代理书记李大林召集紧急会议。
会议做出省委机关迁往粤北，成立中共西南、东南特委，省委常委分赴各地分片领导，广州市委组织部长陆新带领部分党员从事地下斗争四项重要决定。
直至日寇占领广州前夕，黄文杰才同云广英、陈健撤离广州，到了粤北。在粤北他指导成立了八路军韶关办事处，以领导广东各地的抗日战争。
同年11月，黄文杰又回到韶关传达党的六届六中全会精神。他指出：日本帝国主义正扩大侵华战争，妄图打通粤汉铁路占领长江中下游流域，我们党要放手发动群众，独立自主地开展敌后抗日游击战争，不要被国民党捆绑手脚；要批判王明的一切经过统一战线的右倾机会主义路线；对国民党要坚持又团结又斗争，以斗争求团结的方针。为贯彻落实党中央的决议，黄文杰做了大量而具体的工作。
省委常委尹林平认为，自己是军队干部，曾写报告拟辞去党务工作，专搞军事。
黄文杰特地找尹谈话：“看过你的报告，但局党委仍要你兼任党务工作，你不要回部队了，到东江地区去开展抗日游击战争。”
尹林平愉快地服从组织安排，到东江任特委书记，继而兼任东江两支抗日游击队政委，卓有成效地领导东江人民进行抗日战争。
为了党的事业，长期在艰苦环境下东奔西跑，忘我工作的黄文杰，1938年冬发现自己患了肺病。经过一段时间的治疗，刚刚好转，他就又毅然接受中共南方局书记周恩来布置的任务。
黄文杰在南方局负责党的组织工作，继续为巩固发展南方各省市党组织，以适应抗日战争的需要而努力工作。当时，国民党顽固派实行消极抗战，积极反共的政策，制订了《限制异党活动办法》等反动措施。
为了对付国民党的无理进攻，全面领导我党在国统区的工作，南方局书记周恩来同叶剑英、董必武、邓颖超等在渝召集南方各省领导人开会。
黄文杰出席了这次会议。会议决定深入发动群众壮大党的力量，巩固党的组织。围绕这个中心任务，实行组织审查，严格组织纪律，加强党的教育，纠正不良倾向，巩固发展统一战线，动员全党全民同国民党的投敌反共逆流作斗争，推动南方各省的抗日救亡运动。
会后，黄文杰忠实执行党的决定。在南方局领导下，认真抓了党的组织建设和思想建设。他先后在重庆机房街70号和红岩咀13号主持举办党员训练班。集中训练国统区地下党员骨干。
训练班的学习内容为政治形势、党的方针任务、马列主义基本理论、社会发展史、党的组织建设，以及宣传工作、群众工作、秘密工作等，参加讲课的有周恩来、董必武、博古、凯丰、邓颖超、蒋南翔等。
黄文杰不仅为学员讲话，还为训练班的组织领导、课程设置、教材审定、生活管理诸方面做了大量工作。
与此同时，南方局所属省市党委亦分别在各地举办党员训练班。这些党训班的开办，造就了一大批忠于党的干部，为巩固和加强国统区党组织和后来转入隐蔽打下了基础。
1939年2月，当时任第十八集团军参谋长的叶剑英在南岳担任国民政府军事委员会西南游击干部训练班的副教育长。黄文杰也奉命参加了训练班的工作。黄文杰积极协助叶剑英做好训练班的组织安排，掌握学员的思想动态，向学员宣传抗日民族统一战线政策，并且将苏联出版的游击战术教材翻译成中文，还翻译了苏联百科全书中有关的四五篇文章，供叶剑英等人讲授。叶剑英对黄文杰的工作甚为满意。
1939年7月，日本飞机经常对国民党的陪都重庆狂轰滥炸，当时患伤寒病的黄文杰，因躲避日机轰炸，在防空洞里受了凉而发高烧，抢救无效。8月2日不幸逝世，终年仅37岁。