1.多部门协同防控机制薄弱。需要多个政府职能部门和研究机构、制药企业协同，才能有效整合资源，控制丙肝的发生和发展。

2.公众和非专科医务人员对丙肝认知度低。目前对公众的丙肝教育严重不足，一般人群没有认识到丙肝的严重性，对疾病传播途径缺乏了解，自我防护意识不足，主动筛查率和诊断率低。

3.丙肝诊断率和治疗率低。据推测，我国慢性丙肝患者目前接受治疗者在总感染人群中的占比不到1.3%。多数HCV感染者并未意识到自身病情，而且没有接受相应的治疗；丙肝的新治疗方案在我国也还没有普及。

4.丙肝抗病毒药物的可获得性和可负担性低。我国丙肝患者的治疗还是以自费为主；新的全口服DAA大大提高了患者的治疗率、治疗有效率和治疗安全性，应当通过加强医保等方式提高治疗的可负担性，使更多的丙肝患者得到及时有效的治疗。

5.丙肝监测资料欠完善。目前感染HCV的确切人数有待核实。