林兰教授从事中医、中西医结合治疗内分泌代谢性疾病50余年，作为著名的中医专家，她勤求古训、博采众长，锐意进取，不断创新，在中医治疗糖尿病及其并发症、甲状腺疾病等方面积累了丰富的经验，形成了自己独特的学术思想，为学界所公认。

自20世纪70年代开始，由她主持的中国中医研究院广安门医院内二科糖尿病组，开始着手进行“糖尿病中医证治研究”这一课题，最终提出了中医治疗糖尿病的“三型辨证”理论。

该研究对1973年—1980年的328例成人糖尿病患者，运用四诊所得，以包含阴、阳、表、里、寒、热、虚、实的八纲辨证为纲，以脏腑辨证为目，进行了系统的宏观辨证和微观检测。发现糖尿病患者分为热盛、阴虚、气虚、阳虚等四大证候群。由证候辨证所示，糖尿病患者临床并非表现单一证候，而以2种或2种以上证候相互参见，经分析、综合、归纳、组合为三型：其中阴虚证兼有热盛证者共39例，占11.89%；阴虚证兼见气虚证者共251例，占76.52%；阴虚证兼见阳虚证者共38例，占11.59%，部分证候中兼夹瘀血痰湿。并将其分为阴虚热盛、气阴两虚、阴阳两虚等三大主要证型，其中，由于阴虚在三型中均有，故认为阴虚贯穿糖尿病的始终。至此，“三型辨证”理论基本形成。在其后对926例患者的临床研究中，通过对目标人群的辨证客观指标研究，并结合西医的结论加以考察，发现并证实了“三型辨证”的分型是客观的，是动态变化的，是符合现代糖尿病演变规律的。

“三型”证候各有不同的临床特点、内在规律和证治特点。以“三型辨证”为基础，根据病变脏腑不同，个体禀赋不一，“三型辨证”对各型存在的不同亚型展开分层论治（分层辨证）。至此，糖尿病“三型辨证”理论体系日臻完善。此后以三型辨证为诊疗特色，搭建了以北京为中心，辐射全国的糖尿病中医临床和科学研究平台。以三型辨证为诊疗特色，广安门医院内分泌科成为全国中医糖尿病领先专科、北京市中医糖尿病优势专科，为国家医学继续教育、国家药品临床新药研发机构，北京市和国家行业专项临床基地。每年承办国家医学继续教育项目“糖尿病三型辨证诊疗技术”培训班，基于三型辨证临床应用，客观评价中医药对糖尿病的疗效，确定具有普遍意义的糖尿病中药新药临床研究规范方案，建立了适宜临床评价指标体系，在专家共识基础上，制定了《中西医结合糖尿病诊疗标准（草案）》。

基于三型辨证理论，林兰教授主持和参与制定了若干糖尿病中医标准、规范和指南。1986年、1992年和2003年先后制定和修订了《中药新药治疗指导原则》；2007年编写了《WHO西太区用于2型糖尿病的传统医学临床实践指南》；三型辨证先后被《糖尿病中医防治指南》《2型糖尿病中西医结合诊疗规范》及《中医内科诊疗指南》（2008年中华中医药学会）等采用为辨证标准。

在多年的临床研究中，林兰教授发现70%以上糖尿病患者伴有血瘀证，而血瘀证与血管病变有着共同的分布规律和发展趋向。她认为血瘀为血管病变的病理基础，血管病变为血瘀证的临床表现。因此先后研制了益气养阴、活血化瘀的“降糖通脉宁胶囊”“糖心平胶囊”“糖微康胶囊”，对糖尿病肾、心、眼、脑、下肢血管和周围神经病变进行了临床和实验研究，证实中医药能逆转早期微血管病变，延缓各种血管并发症的发生和发展。通过血液动力学、血管活性因子、组织基因DNA甲基化等手段，从细胞学、分子生物学、基因学角度阐释临床疗效、指标改善的机制。同时亦建立了相关临床和实验研究方法及临床疗效评价指标。